De nieuwste versies van de Internet Explorer (5.5 SP2 en 6.0) bieden geen ondersteuning meer voor Netscape plugins. Dat betekent dat het bekijken van onder meer QuickTime-filmpjes in de nieuwste browsers niet meer mogelijk is. Om dit probleem op te lossen heeft Apple een 'ActiveX control' beschikbaar gesteld via haar website die het compatibiliteitsprobleem moet oplossen. Verder geeft Apple op haar site een handleiding aan website ontwikkelaars hoe problemen met QuickTime en de Internet Explorer verholpen kunnen worden. Het QuickTime-probleem benadrukt het besluit van Microsoft om steeds meer afstand te nemen van 'plug-ins', een technologie die ontwikkeld is door Netscape om de functionaliteit van webbrowsers verder uit te breiden. Vanaf IE 5.5 SP2 is de plug-in functionaliteit uit de browser gehaald. In plaats daarvan is de internetbrowser gebouwd rondom ActiveX, een techniek van Microsoft die toepassingen met internet verbindt. ActiveX wordt door velen gezien als een geduchte tegenhanger van Sun's Java. Microsoft biedt vanaf versie 6 van de browser ook geen ondersteuning meer voor Java.