Het ministerie van Justitie en de beurswaakhond Securities and Exchange Commission (SEC) hebben al enige tijd Computer Associates in onderzoek, maar dit spitste zich toe op een periode uit 1998, toen drie topmannen van CA een aandelenbonus van 1,1 miljard dollar ontvingen. Er is echter veel meer aan de hand, zo schrijft The Wall Street Journal. Een aantal ex-medewerkers beweert dat het softwarebedrijf over een langere periode met zijn boeken zou hebben gerommeld. Hierbij werden bijvoorbeeld klantencontracten van een andere datum voorzien, als dat beter uitkwam bij de kwartaalresultaten. De beweringen zijn gedaan in het lopende onderzoek van Justitie en de SEC. Het is nog onduidelijk of de praktijken daadwerkelijk de boekhoudregels overtreden. Het onderzoek concentreert zich onder meer op het eerste kwartaal van 2000, toen Computer Associates een contract ter waarde van 8,7 miljoen dollar bijschreef in de boeken, ondanks dat dit contract intern nog niet was goedgekeurd. Verder zou CA `gratis' software hebben gebundeld met onderhoudscontracten om zo de omzetten wat op te krikken. Computer Associates is onder meer bekend van eTrust (anti-virus en firewalls), Unicenter (Enterprise Management) en BrightStor (opslag).