Inmiddels heeft de softwarereus een acht jaar lopend conflict rond patent 5.838.906 in handen van het bedrijf Eolas. Het patent omschrijft een technologie waardoor interactieve elementen, zoals plugins en applets, door de browser kunnen worden uitgevoerd. Microsoft stelt de eerste te zijn die de technologie heeft uitgevonden, en het daarom geen patenten kan schenden.

De zaak kwam aan het rollen toen Eolas in 1997 een aanklacht indiende. In augustus 2003 bepaalde de rechter dat Microsoft software moest aanpassen en 520,6 miljoen dollar schadevergoeding moest betalen. Dit vonnis werd in maart 2005 in hoger beroep verworpen. De USPTO stelde Eolas in datzelfde jaar echter in het gelijk.

De USPTO is desondanks niet helemaal zeker van zijn zaak en heropent deze nu om antwoord te krijgen op de vraag wie er nu eerder was met de technologie en of er patenten worden geschonden.